Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim6Q3U0I6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms