Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr4Q3TQS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Calr4Q3TQS0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms