Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdnep1Q3TP92 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms