Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp39Q3TIX9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms