Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f1Q3THK3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms