Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eepd1Q3TGW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eepd1Q3TGW2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms