Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnlQ3TD16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms