Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd2bQ3T9M1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms