Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms