Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptcd3Q14C51 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptcd3Q14C51 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms