Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms