Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VgfQ0VGU4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms