Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smim24Q0VG18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms