Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttc39dQ0VF76 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms