Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp2b3Q0VF55 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2b3Q0VF55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms