Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rundc1Q0VDN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms