Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vps8Q0P5W1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps8Q0P5W1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms