Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata18Q0P557 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms