Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf541Q0GGX2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms