Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnnm1Q0GA42 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms