Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
1700061G19RikQ08EE8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms