Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Runx2Q08775 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Runx2Q08775 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Runx2Q08775 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms