Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SctQ08535 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SctQ08535 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SctQ08535 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SctQ08535 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SctQ08535 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SctQ08535 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SctQ08535 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SctQ08535 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SctQ08535 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SctQ08535 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SctQ08535 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms