Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F13bQ07968 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13bQ07968 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms