Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx4Q07424 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdx4Q07424 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms