Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms