Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc2Q05020 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms