Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top1Q04750 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top1Q04750 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms