Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col6a2Q02788 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col6a2Q02788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms