Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GscQ02591 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GscQ02591 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GscQ02591 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GscQ02591 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GscQ02591 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GscQ02591 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GscQ02591 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GscQ02591 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms