Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd1Q02242 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms