Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms