Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RykQ01887 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RykQ01887 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RykQ01887 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RykQ01887 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RykQ01887 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms