Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VcpQ01853 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VcpQ01853 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VcpQ01853 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VcpQ01853 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms