Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms