Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Top2aQ01320 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms