Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelpQ01102 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelpQ01102 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms