Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Grin2bQ01097 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Grin2bQ01097 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms