Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms