Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmmrQ00547 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HmmrQ00547 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmmrQ00547 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmmrQ00547 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmmrQ00547 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmmrQ00547 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmmrQ00547 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmmrQ00547 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms