Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabpb1Q00420 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms