Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shc1P98083 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms