Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp6P97868 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms