Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms