Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms