Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig3P97386 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig3P97386 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig3P97386 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms