Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1b3P97370 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b3P97370 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms