Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SmsP97355 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SmsP97355 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SmsP97355 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SmsP97355 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SmsP97355 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SmsP97355 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SmsP97355 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SmsP97355 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SmsP97355 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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SmsP97355 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SmsP97355 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SmsP97355 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SmsP97355 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SmsP97355 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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SmsP97355 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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SmsP97355 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SmsP97355 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SmsP97355 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SmsP97355 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SmsP97355 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms