Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhodP97348 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RhodP97348 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhodP97348 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhodP97348 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhodP97348 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhodP97348 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhodP97348 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhodP97348 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhodP97348 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhodP97348 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhodP97348 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhodP97348 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhodP97348 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms