Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mesp1P97309 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms